Depuis 1986, les populations de phoque moine de Méditerranée sont au centre du Plan d’action du PNUE pour la Méditerranée. Le phoque moine de Méditerranée est également l’une des principales espèces de mammifères marins ciblées par les mesures de conservation de la CMS. Comptant parmi les mammifères marins les plus menacés dans le monde, il figure aux annexes de la Convention. Son inscription à l’Annexe I engage les États membres à interdire sa chasse et sa capture, ainsi qu’à conserver son habitat et à contrer les facteurs entravant sa migration. Cela comprend également le suivi des autres menaces, ainsi que la prévention de toute perturbation de l’espèce.