Además de desarrollar un Plan de Acción, los signatarios se comprometen a evaluar su implementación en las reuniones ordinarias, y a informar de cualquier avance en la conservación de estas especies a la Secretaría. En general, las actividades en el marco del MdE se orientan hacia la protección efectiva de los flamencos altoandinos a través de la conservación de los hábitats de los cuales dependen a través de todo su ciclo de vida.

La CMS ha contribuido significativamente al desarrollo de la capacidad regional a través del Programa de Pequeñas Subvenciones de la CMS (SGP, por sus siglas en inglés). En 2011, la CMS y el Centro de Estudios en Biología Teórica y Aplicada (BIOTA) en Bolivia acordaron cooperar en un gran proyecto para monitorear estas especies. Los resultados de este proyecto contribuyeron a evaluar el éxito de la reproducción de flamencos alto andinos en Bolivia y Argentina durante el período 2011-2012. También ayudó en la identificación de las principales amenazas para su conservación en estos países.