Le premier lauréat du Prix de thèse PNUE/CMS, élu par le jury en juillet 2005, était le Dr Zeb Hogan, un scientifique des États-Unis. Il a été récompensé pour son travail intitulé « The Ecology, Genetics, and Conservation of Migratory Catfish (Pangasiidae) in the Mekong River » [L’écologie, la génétique et la conservation des poissons-chats migrateurs (Pangasiidae) dans le Mékong]. Le Dr Carlos Rodriguez, d’Espagne, et le Dr Rodrigo Hucke-Gaete, du Chili, ont été élus deuxième et troisième lauréats.

En 2008, le lauréat du Prix de thèse CMS était le Dr Samantha Petersen, d’Afrique du Sud, pour son travail « Understanding and Mitigating Vulnerable Bycatch in southern African Trawl and Longline Fisheries » [Comprendre et atténuer les prises accessoires et vulnérables du chalutage et de la pêche à la palangre en Afrique australe]. Les prises accessoires constituent une préoccupation majeure pour la CMS, car elles affectent de nombreuses espèces migratrices dont les albatros et les pétrels, ainsi que les tortues marines, les requins et les cétacés.